Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6M7

SLC4A7, Sodium bicarbonate cotransporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A7Q9Y6M7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC4A7Q9Y6M7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A7Q9Y6M7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A7Q9Y6M7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A7Q9Y6M7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A7Q9Y6M7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A7Q9Y6M7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms