Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SHOC2Q9UQ13 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHOC2Q9UQ13 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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