Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CWC15Q9P013 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CWC15Q9P013 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms