Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPRMQ9NS64 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPRMQ9NS64 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms