Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCA3Q99618 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCA3Q99618 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms