Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPDL3AQ92484 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPDL3AQ92484 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms