Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 38.4
PUM2Q8TB72 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.011e-8■■■■■ 38.4
PUM2Q8TB72 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.121e-8■■■■■ 38.4
PUM2Q8TB72 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.361e-8■■■■■ 38.4
PUM2Q8TB72 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.822e-12■■■■■ 38.4
PUM2Q8TB72 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.972e-12■■■■■ 38.4
PUM2Q8TB72 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.042e-12■■■■■ 38.4
PUM2Q8TB72 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 38.4
PUM2Q8TB72 BTBD7-203ENST00000355125 6822 ntTSL 24.87□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 38.4
PUM2Q8TB72 PDS5B-203ENST00000450460 5246 ntTSL 1 (best)1.89□□□□□ -2.112e-7■■■■■ 38.4
PUM2Q8TB72 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-27■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.686e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.476e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.066e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.017e-11■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 17e-11■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.996e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.976e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.926e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.886e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.846e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SSNA1-202ENST00000459860 1170 ntTSL 1 (best)20.16■□□□□ 0.826e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RPP38-202ENST00000378201 833 ntTSL 520.11■□□□□ 0.817e-11■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.796e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.776e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RPP38-204ENST00000378203 1296 ntAPPRIS P1 TSL 219.39■□□□□ 0.697e-11■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RPP38-206ENST00000451677 323 ntTSL 319.32■□□□□ 0.687e-11■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.656e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.637e-11■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.616e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.616e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-210ENST00000519569 2355 ntTSL 218.54■□□□□ 0.566e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-219ENST00000521766 2736 ntTSL 218.47■□□□□ 0.556e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.546e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.496e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-202ENST00000440963 575 ntTSL 217.86■□□□□ 0.456e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.426e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-203ENST00000458117 782 ntTSL 217.54■□□□□ 0.46e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.376e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.366e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-215ENST00000520266 878 ntTSL 316.98■□□□□ 0.316e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.296e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-229ENST00000523485 2705 ntTSL 216.79■□□□□ 0.286e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.276e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.266e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.246e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.246e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.226e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.156e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.146e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.136e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.096e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.096e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.066e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.067e-11■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-207ENST00000518686 2897 ntTSL 215.41■□□□□ 0.066e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.016e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.016e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -06e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.046e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.086e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-208ENST00000489117 770 ntTSL 314.5□□□□□ -0.096e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.116e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.126e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.126e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.126e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.166e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CTDSP1-205ENST00000452977 818 ntTSL 514.03□□□□□ -0.166e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CTDSP1-202ENST00000428361 842 ntTSL 514.03□□□□□ -0.166e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.186e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.226e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.36e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.316e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NSRP1-206ENST00000540900 2057 ntTSL 513.03□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.326e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.396e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.416e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.426e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-205ENST00000474271 540 ntTSL 412.32□□□□□ -0.446e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.446e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.456e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 H6PD-202ENST00000495451 2701 ntTSL 212.16□□□□□ -0.466e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.476e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-236ENST00000559138 2041 ntTSL 1 (best)12.06□□□□□ -0.486e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CTDSP1-210ENST00000491064 786 ntTSL 312.03□□□□□ -0.486e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 MOK-238ENST00000559838 643 ntTSL 312.01□□□□□ -0.496e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CTDSP1-206ENST00000464255 926 ntTSL 511.99□□□□□ -0.496e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-218ENST00000477422 915 ntTSL 211.91□□□□□ -0.56e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.536e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.556e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CAMSAP2-202ENST00000358823 7352 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.586e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.596e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 BCS1L-215ENST00000460579 985 ntTSL 311.3□□□□□ -0.66e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.636e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.666e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 SGK1-204ENST00000367858 3201 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.676e-6■■■■■ 38.3
PUM2Q8TB72 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 510.75□□□□□ -0.696e-6■■■■■ 38.3
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 146.2 ms