Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SHISA6Q6ZSJ9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA6Q6ZSJ9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms