Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KRT80Q6KB66 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRT80Q6KB66 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms