Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFRP4Q6FHJ7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFRP4Q6FHJ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms