Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T1

TMEM170B, Transmembrane protein 170B, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM170BQ5T4T1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM170BQ5T4T1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM170BQ5T4T1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms