Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAPPC3LQ5T215 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3LQ5T215 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms