Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR44Q5JSH3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms