Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EXOSC2Q13868 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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