Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ACACAQ13085 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACACAQ13085 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACACAQ13085 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACACAQ13085 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms