Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CXCL9Q07325 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms