Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
XPCQ01831 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
XPCQ01831 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
XPCQ01831 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XPCQ01831 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XPCQ01831 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XPCQ01831 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XPCQ01831 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XPCQ01831 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
XPCQ01831 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
XPCQ01831 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
XPCQ01831 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
XPCQ01831 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
XPCQ01831 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
XPCQ01831 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
XPCQ01831 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XPCQ01831 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XPCQ01831 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XPCQ01831 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XPCQ01831 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
XPCQ01831 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XPCQ01831 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XPCQ01831 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
XPCQ01831 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
XPCQ01831 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
XPCQ01831 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
XPCQ01831 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
XPCQ01831 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XPCQ01831 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XPCQ01831 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
XPCQ01831 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
XPCQ01831 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
XPCQ01831 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
XPCQ01831 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
XPCQ01831 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
XPCQ01831 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
XPCQ01831 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
XPCQ01831 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XPCQ01831 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XPCQ01831 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XPCQ01831 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
XPCQ01831 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XPCQ01831 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
XPCQ01831 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
XPCQ01831 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
XPCQ01831 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms