Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FLI1Q01543 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FLI1Q01543 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms