Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA9P57773 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA9P57773 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA9P57773 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA9P57773 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA9P57773 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA9P57773 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA9P57773 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA9P57773 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA9P57773 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA9P57773 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA9P57773 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA9P57773 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA9P57773 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA9P57773 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA9P57773 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA9P57773 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA9P57773 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA9P57773 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA9P57773 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA9P57773 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA9P57773 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA9P57773 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA9P57773 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJA9P57773 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA9P57773 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA9P57773 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA9P57773 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA9P57773 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA9P57773 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA9P57773 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA9P57773 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA9P57773 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA9P57773 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA9P57773 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA9P57773 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA9P57773 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA9P57773 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA9P57773 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA9P57773 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA9P57773 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA9P57773 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA9P57773 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA9P57773 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA9P57773 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA9P57773 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA9P57773 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA9P57773 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA9P57773 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA9P57773 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJA9P57773 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA9P57773 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA9P57773 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA9P57773 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA9P57773 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA9P57773 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA9P57773 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA9P57773 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA9P57773 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA9P57773 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA9P57773 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJA9P57773 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA9P57773 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA9P57773 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA9P57773 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA9P57773 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms