Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP9P55211 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP9P55211 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP9P55211 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP9P55211 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP9P55211 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP9P55211 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP9P55211 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms