Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CRISP3P54108 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms