Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MRE11P49959 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRE11P49959 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRE11P49959 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRE11P49959 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRE11P49959 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRE11P49959 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRE11P49959 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRE11P49959 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRE11P49959 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRE11P49959 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRE11P49959 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRE11P49959 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRE11P49959 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRE11P49959 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRE11P49959 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MRE11P49959 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRE11P49959 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRE11P49959 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRE11P49959 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRE11P49959 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRE11P49959 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRE11P49959 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRE11P49959 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRE11P49959 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRE11P49959 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRE11P49959 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRE11P49959 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRE11P49959 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRE11P49959 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRE11P49959 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRE11P49959 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRE11P49959 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRE11P49959 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRE11P49959 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRE11P49959 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRE11P49959 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRE11P49959 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRE11P49959 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRE11P49959 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRE11P49959 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRE11P49959 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRE11P49959 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRE11P49959 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRE11P49959 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRE11P49959 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRE11P49959 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRE11P49959 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRE11P49959 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRE11P49959 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRE11P49959 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRE11P49959 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRE11P49959 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRE11P49959 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRE11P49959 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRE11P49959 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRE11P49959 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms