Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTBP49356 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTBP49356 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTBP49356 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTBP49356 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTBP49356 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTBP49356 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FNTBP49356 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTBP49356 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTBP49356 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTBP49356 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTBP49356 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTBP49356 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTBP49356 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTBP49356 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTBP49356 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FNTBP49356 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FNTBP49356 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNTBP49356 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNTBP49356 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNTBP49356 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNTBP49356 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNTBP49356 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNTBP49356 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNTBP49356 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FNTBP49356 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNTBP49356 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms