Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASQ1P31415 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASQ1P31415 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASQ1P31415 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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