Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCNA2P20248 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCNA2P20248 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms