Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA2P15927 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA2P15927 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA2P15927 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA2P15927 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA2P15927 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA2P15927 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA2P15927 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA2P15927 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA2P15927 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPA2P15927 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA2P15927 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA2P15927 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA2P15927 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA2P15927 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA2P15927 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA2P15927 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA2P15927 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA2P15927 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA2P15927 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPA2P15927 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPA2P15927 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPA2P15927 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA2P15927 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA2P15927 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA2P15927 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA2P15927 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA2P15927 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA2P15927 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA2P15927 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA2P15927 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA2P15927 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPA2P15927 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms