Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSCO60682 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSCO60682 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MSCO60682 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSCO60682 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSCO60682 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSCO60682 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSCO60682 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSCO60682 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSCO60682 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSCO60682 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSCO60682 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MSCO60682 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MSCO60682 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSCO60682 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSCO60682 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSCO60682 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSCO60682 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSCO60682 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSCO60682 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSCO60682 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSCO60682 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSCO60682 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSCO60682 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MSCO60682 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSCO60682 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSCO60682 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSCO60682 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSCO60682 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSCO60682 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSCO60682 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSCO60682 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MSCO60682 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSCO60682 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSCO60682 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSCO60682 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSCO60682 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSCO60682 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MSCO60682 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSCO60682 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSCO60682 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSCO60682 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSCO60682 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSCO60682 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSCO60682 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSCO60682 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSCO60682 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSCO60682 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSCO60682 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSCO60682 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSCO60682 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSCO60682 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSCO60682 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSCO60682 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSCO60682 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms