Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 MIB2-228ENST00000512004 598 ntTSL 411.97□□□□□ -0.497e-13■■■■■ 27.7
RBFOX2O43251 PIDD1-211ENST00000534649 754 ntTSL 214.45□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 BICRA-202ENST00000594866 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.08■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.075e-21■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.315e-21■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.435e-21■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 OCIAD1-205ENST00000444354 1756 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.955e-21■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 OCIAD1-203ENST00000396448 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.955e-21■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 OCIAD1-201ENST00000264312 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.025e-21■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.025e-21■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 OCIAD1-206ENST00000502972 1916 ntTSL 26.07□□□□□ -1.445e-21■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.625e-21■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 CXXC1-217ENST00000592078 686 ntTSL 212.33□□□□□ -0.442e-11■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 VSNL1-202ENST00000404666 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 VSNL1-201ENST00000295156 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 VSNL1-204ENST00000451533 562 ntTSL 47.92□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.651e-7■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 VSNL1-205ENST00000457525 576 ntTSL 34.43□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 27.6
RBFOX2O43251 SORBS3-215ENST00000522721 601 ntTSL 417.84■□□□□ 0.451e-13■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 SORBS3-202ENST00000517500 1228 ntTSL 216.48■□□□□ 0.231e-13■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 SORBS3-212ENST00000521787 561 ntTSL 415.14■□□□□ 0.011e-13■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 SORBS3-218ENST00000523740 983 ntTSL 314.95□□□□□ -0.021e-13■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 SORBS3-214ENST00000522315 563 ntTSL 413.48□□□□□ -0.251e-13■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 SORBS3-211ENST00000521554 858 ntTSL 211.94□□□□□ -0.51e-13■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 SORBS3-207ENST00000519453 560 ntTSL 411.56□□□□□ -0.561e-13■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 SORBS3-219ENST00000523900 670 ntTSL 310.6□□□□□ -0.711e-13■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 ACOX1-203ENST00000572047 2441 ntTSL 212.5□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 ACOX1-207ENST00000588176 574 ntTSL 412.49□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 ACOX1-209ENST00000589301 550 ntTSL 411.81□□□□□ -0.526e-7■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 ACOX1-204ENST00000573078 2417 ntTSL 29.3□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.166e-7■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 ACOX1-211ENST00000591857 681 ntTSL 37.45□□□□□ -1.226e-7■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.925e-9■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 NCKAP5L-204ENST00000480927 533 ntTSL 414.36□□□□□ -0.116e-21■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 RANBP1-211ENST00000448394 688 ntTSL 211.36□□□□□ -0.593e-9■■■■■ 27.5
RBFOX2O43251 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.624e-9■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 HEXDC-212ENST00000582429 1824 ntTSL 218.1■□□□□ 0.494e-9■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.074e-9■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 HEXDC-213ENST00000583354 686 ntTSL 515.28■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 HEXDC-204ENST00000578130 853 ntTSL 212.79□□□□□ -0.364e-9■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 HEXDC-205ENST00000578616 862 ntTSL 310.72□□□□□ -0.694e-9■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 RAC3-204ENST00000585014 798 ntTSL 214.71□□□□□ -0.051e-24■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.949e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.929e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.99e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.856e-12■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.859e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.429e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.279e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 C11orf80-209ENST00000527368 812 ntTSL 516.64■□□□□ 0.259e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.119e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.089e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 DDAH2-217ENST00000469963 1682 ntTSL 515.51■□□□□ 0.076e-12■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 C11orf80-202ENST00000524551 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.07■□□□□ 09e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 DDAH2-218ENST00000480913 937 ntTSL 514.75□□□□□ -0.059e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 C11orf80-217ENST00000534325 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.21□□□□□ -0.139e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 DDAH2-214ENST00000416410 887 ntTSL 213.56□□□□□ -0.246e-12■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.39e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 DDAH2-215ENST00000436437 882 ntTSL 313.08□□□□□ -0.326e-12■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.348e-10■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 FAM50A-204ENST00000478509 682 ntTSL 311.56□□□□□ -0.569e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ANKLE2-206ENST00000538766 1557 ntTSL 211.47□□□□□ -0.579e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 CMSS1-202ENST00000463526 397 ntTSL 311.34□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.719e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 SYNGAP1-224ENST00000637721 190 ntTSL 59.99□□□□□ -0.819e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 DDAH2-219ENST00000483792 898 ntTSL 59.7□□□□□ -0.869e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 DDAH2-216ENST00000437288 724 ntTSL 59.7□□□□□ -0.869e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 FAM50A-205ENST00000481619 763 ntTSL 29.57□□□□□ -0.889e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ANKLE2-203ENST00000505031 2861 ntTSL 39.28□□□□□ -0.929e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 CMSS1-208ENST00000496116 2145 ntTSL 1 (best)9.19□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ANKLE2-202ENST00000439231 1725 ntTSL 39.08□□□□□ -0.969e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ZNF321P-201ENST00000313956 2341 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.989e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 AC010487.3-201ENST00000634278 1966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.19e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ARHGAP24-211ENST00000512201 567 ntTSL 48.12□□□□□ -1.119e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ANKLE2-209ENST00000542374 515 ntTSL 37.84□□□□□ -1.159e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 C11orf80-211ENST00000531400 367 ntTSL 37.77□□□□□ -1.179e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ITGA2B-202ENST00000587295 496 ntTSL 36.97□□□□□ -1.299e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ZNF816-ZNF321P-201ENST00000391777 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.349e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 CMSS1-206ENST00000491299 881 ntTSL 56.63□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ARHGAP24-208ENST00000506421 857 ntTSL 35.89□□□□□ -1.479e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 SYNGAP1-218ENST00000636905 123 ntTSL 54.6□□□□□ -1.679e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 ARHGAP24-210ENST00000509709 631 ntTSL 24.48□□□□□ -1.699e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.349e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.933e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 MED15-218ENST00000451058 418 ntTSL 314.73□□□□□ -0.055e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 MED15-221ENST00000473028 556 ntTSL 413.63□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 MED15-216ENST00000445189 596 ntTSL 412.02□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 EIF3B-211ENST00000475415 3745 ntTSL 28.56□□□□□ -1.045e-7■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 SBNO2-206ENST00000587673 1209 ntTSL 517.71■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 SBNO2-203ENST00000586109 465 ntTSL 313.3□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 27.4
RBFOX2O43251 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 27.3
RBFOX2O43251 SMPD4-210ENST00000441135 699 ntTSL 414.25□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 27.3
Retrieved 100 of 22,255 protein–RNA pairs in 181.1 ms