Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 GSG1L-205ENST00000569166 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC004233.4-201ENST00000621689 417 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 ZNF488-201ENST00000585316 3496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 BOLA3-AS1-203ENST00000533563 1599 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 SEC22B-201ENST00000578049 6922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 KPRP-201ENST00000606109 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 PARP6-202ENST00000287196 2625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 RPRD2-202ENST00000369068 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 TMC3-202ENST00000558726 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 FN1-203ENST00000354785 8905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 FLT3-201ENST00000241453 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 ZNF100-206ENST00000608416 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 FCGR2B-202ENST00000358671 2115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 ADAM1A-201ENST00000424240 2129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 AL591742.2-201ENST00000632517 2119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 ITIH4-202ENST00000406595 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-201ENST00000310771 3634 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 CAPS-203ENST00000588776 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 KCTD20-204ENST00000449081 4094 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 ITGAL-202ENST00000358164 4673 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RORCP51449 GRM8-203ENST00000358373 3850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 ADGRG1-214ENST00000562558 3858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 TCF4-222ENST00000564228 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 CACNB4-204ENST00000427385 1776 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 HINFP-204ENST00000527410 1466 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 ZIC4-202ENST00000425731 3979 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 ADH7-204ENST00000476959 1325 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 RNLS-202ENST00000371947 3385 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 DRD1-201ENST00000393752 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 UGT1A7-201ENST00000373426 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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RORCP51449 SNX20-201ENST00000300590 3304 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 MAPKBP1-202ENST00000457542 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 SETD4-201ENST00000332131 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 GRAP2-201ENST00000344138 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 VPS4A-201ENST00000254950 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 ACTC1-201ENST00000290378 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 TUBE1-202ENST00000368662 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 AL357055.2-201ENST00000412567 434 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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RORCP51449 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC106875.1-202ENST00000435175 1170 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 OR7E111P-201ENST00000442229 1014 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 LINC01046-201ENST00000443719 405 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC120057.3-201ENST00000570760 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 ZNF548-209ENST00000598895 571 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 Metazoa_SRP.174-201ENST00000619127 283 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 CYP17A1-205ENST00000638272 1227 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 FAM124B-203ENST00000409685 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 YME1L1-207ENST00000477432 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 TROAP-215ENST00000551245 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 AC011487.2-202ENST00000599707 1356 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 PLXNB2-213ENST00000610984 3443 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RORCP51449 TTC12-219ENST00000529221 2315 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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