Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GTF3C2-201ENST00000264720 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 DGKI-213ENST00000614521 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CNOT2-201ENST00000229195 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GSTM5-201ENST00000256593 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ADAMTS9-210ENST00000498707 7624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NONO-215ENST00000535149 2882 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LAMP3-202ENST00000466939 1453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ADAM2-203ENST00000379853 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC078925.3-201ENST00000623434 2500 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 WSB1-202ENST00000348811 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LINC01442-202ENST00000618872 1600 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RBM7-209ENST00000624815 3587 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 COL5A2-203ENST00000618828 6399 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SLC28A1-204ENST00000538177 2155 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LINC02487-201ENST00000400831 2557 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MSL3-207ENST00000398527 2324 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TRIM26-266ENST00000437089 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 KIF2C-202ENST00000372224 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SLC38A7-206ENST00000564100 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 HMGB3P4-201ENST00000428776 514 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 APOC1P1-204ENST00000575148 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AP000553.4-201ENST00000641967 471 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PUS7L-202ENST00000416848 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LRRTM4-204ENST00000409884 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 MST1L-202ENST00000455405 3184 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ZFAT-208ENST00000520356 4273 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC008132.1-203ENST00000412938 5920 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PAX3-204ENST00000350526 3610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GYG1-210ENST00000484197 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ARSG-202ENST00000452479 1733 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 PRAMEF8-203ENST00000621519 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 BLACAT1-201ENST00000626538 2994 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CTAGE16P-201ENST00000435601 2412 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CDH8-211ENST00000584337 3986 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 AC108062.1-203ENST00000511497 2012 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 OR2A14-202ENST00000641068 2199 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 CMTR1-201ENST00000373451 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TRPV3-211ENST00000616411 5742 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SF3B2-201ENST00000322535 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ME1-201ENST00000369705 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 C22orf46-201ENST00000402966 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 EPHA6-201ENST00000389672 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 SMAD3-202ENST00000439724 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ERCC3-201ENST00000285398 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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