Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEU3Q9UQ49 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms