Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAMD4AQ9UPU9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD4AQ9UPU9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms