Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRDM4Q9UKN5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRDM4Q9UKN5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms