Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA4Q9UI42 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPA4Q9UI42 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPA4Q9UI42 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms