Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXNA4Q9HCM2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms