Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF541Q9H0D2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms