Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNHG12Q9BXW3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNHG12Q9BXW3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms