Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCM2Q9BSQ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCM2Q9BSQ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 363.4 ms