Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R9BQ96SB3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R9BQ96SB3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms