Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAPPC9Q96Q05 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAPPC9Q96Q05 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms