Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCEEQ96PE7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCEEQ96PE7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms