Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NMD3Q96D46 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMD3Q96D46 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms