Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNPO1Q92973 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNPO1Q92973 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms