Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FRAT1Q92837 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FRAT1Q92837 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FRAT1Q92837 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms