Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMOD2Q6P5Q4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMOD2Q6P5Q4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMOD2Q6P5Q4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms