Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC19Q6DKK2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC19Q6DKK2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms