Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GGNBP1Q5YKI7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGNBP1Q5YKI7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms