Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBAP2Q5T6F2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBAP2Q5T6F2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms