Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RNF212Q495C1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RNF212Q495C1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms