Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SWI5Q1ZZU3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SWI5Q1ZZU3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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